微生物功能多样性决定了其在土壤和农业中的不可替代作用。微生物在土壤中物质、能量的输入输出中扮演着非常重要的角色，能够活化土壤有机与无机养分，分解有机物，释放养分，增加养分的有效性；微生物通过代谢过程中氧气和二氧化碳的交换以及分泌的有机酸等酸性物质，促进土壤中微量元素的释放及螯合，有效打破土壤板结，促进团粒结构的形成，并能改善土壤的通气状况，促进有机质、腐殖酸和腐殖质的生成；微生物在其繁殖和代谢过程中，可以降解土壤中残留的化肥、有机农药、重金属和其他污染物等，降低土壤污染的程度。

微生物菌剂的主要性能和作用

1、提高产量

不仅为农作物提供营养元素，其有效菌还能分泌赤霉素、细胞分裂素、生长素等活性物质，刺激、调节促进作物生长，有利于农作物增产。

2、改善品质

有效地改善农产品品质。作物使用微生物菌剂后，蛋白质、糖分、维生素、氨基酸等有益成分含量明显提高。

3、增强作物的抗逆性功能

有效菌可以分泌类物质和多种活性酶，能抑制或杀死致病菌，降低病害发生，增强作物抗旱、抗寒、抗倒伏、防病及抗盐碱等抗逆性。

4、提高化肥利用率

有效菌能分解土壤中有机质，生成腐殖酸与土壤中的氮形成腐殖酸铵，可减少氮肥的流失。解钾菌能将无效钾分解转化为钾、磷，提高利用率。

5、改善土壤养分

有效菌能够存进土壤中难溶性养分的溶解和释放，提高土壤养分的供应能力。分泌的胞外多糖物质，是土壤团粒结构的粘合剂，能够增强土壤团粒结构，疏松土壤，提高土壤通透性和保水保肥能力，增加土壤有机质，活化土壤中的潜在养分，改善土壤中养分的供应状况。